Rahayu, E. S., Nakayama, J., Watanabe, K., Jiang, J., Matsuda, K., Chao, S. -H., Haryono, P., La-Ongkham, O., Sarwoko, M.-A., Sujaya, I. N., Zhao, L., Chen, K.-T., Chen, Y.-P., Chiu, H.-H., Hidaka, T., Huang, N.-X., Kiyohara, C., Kurakawa, T., Sakamoto, N., Sonomoto, K., Tashiro, K., Tsuji, H., Chen, M.-J., Leelavatcharamas, V., Liao, C.-C, Nitisinprasert, S., Ren, F.-Z., Tsai, Y.-C., Lee, Y.-K.
Asia differs substantially among and within its regions populated by diverse ethnic groups, which maintain their own respective cultures and dietary habits. To address the diversity in their gut microbiota, we characterized the bacterial community in fecal samples obtained from 303 school-age children living in urban or rural regions in five countries spanning temperate and tropical areas of Asia. The microbiota profiled for the 303 subjects were classified into two enterotype-like clusters, each driven by Prevotella (P-type) or Bifidobacterium/Bacteroides (BB-type), respectively. Majority in China, Japan and Taiwan harbored BB-type, whereas those from Indonesia and Khon Kaen in Thailand mainly harbored P-type. The P-type microbiota was characterized by a more conserved bacterial community sharing a greater number of type-specific phylotypes. Predictive metagenomics suggests higher and lower activity of carbohydrate digestion and bile acid biosynthesis, respectively, in P-type subjects, reflecting their high intake of diets rich in resistant starch. Random-forest analysis classified their fecal species community as mirroring location of resident country, suggesting eco-geographical factors shaping gut microbiota. In particular, children living in Japan harbored a less diversified microbiota with high abundance of Bifidobacterium and less number of potentially pathogenic bacteria, which may reflect their living environment and unique diet.
Secara substansial Asia berbeda di antara dan di dalam wilayahnya yang dihuni oleh beragam kelompok etnis, yang memelihara budaya dan kebiasaan makan mereka masing-masing. Untuk mengatasi keragaman mikrobiota usus mereka, kami menandai komunitas bakteri dalam sampel tinja yang diperoleh dari 303 anak usia sekolah yang tinggal di daerah perkotaan atau pedesaan di lima negara yang mencakup wilayah tropis dan sedang di Asia. Mikrobiota yang diprofilkan untuk 303 subjek dikelompokkan menjadi dua kelompok seperti jenis enterotip, masing-masing didorong oleh Prevotella (tipe-P) atau Bifidobacterium / Bacteroides (tipe BB). Mayoritas di China, Jepang dan Taiwan menyimpan tipe BB, sedangkan yang berasal dari Indonesia dan Khon Kaen di Thailand terutama memendam tipe P. Mikrobiota tipe-P ditandai oleh komunitas bakteri yang lebih konservatif yang memiliki lebih banyak jenis filopotipe spesifik. Prediktif metagenomik menunjukkan aktivitas yang lebih tinggi dan menurunkan pencernaan karbohidrat dan biosintesis asam empedu, masing-masing, pada subyek tipe P, yang mencerminkan asupan makanan yang kaya akan pati. Analisis hutan secara acak mengklasifikasikan komunitas spesies tinja sebagai cerminan lokasi negara penduduk, menunjukkan faktor eko-geografis yang membentuk mikrobiota usus. Secara khusus, anak-anak yang tinggal di Jepang menyimpan mikrobiota yang kurang beragam dengan kelimpahan Bifidobacterium yang tinggi dan jumlah bakteri patogen yang kurang, yang mungkin mencerminkan lingkungan hidup dan makanan unik mereka.